搭乘高鐵：
1.至高雄左營站。2.轉乘高雄新左營站墾丁快線客運：
3.東港大鵬灣再轉搭接駁車到東港交通船碼頭。
▪票價：全票144元/半票72元
▪時刻表：每日09：00至19：00發車，間距約每1小時1班車，資訊以墾丁快線網站發佈資訊為準。
台鐵客運：
1.抵達高雄後，可轉乘國光客運、中南客運、高雄客運至墾丁或是東港的車次。2.搭車地點：
▪中南客運建國二路候車站(高雄火車站斜對面，近建國二路及中 山路交叉口)
▪高雄客運南華站(南華路上，高雄車站後方)
▪舊高雄火車站高市願景館對面
3. 於東港輔英醫院站下車後，向三商巧福方向步行約10分鐘就可抵達碼頭。
自行開車：
1.國道一號高速公路南下由小港機場出口沿省道十七號公路，往東港行駛即可抵達東港碼頭，再搭交通船到小琉球。2.國道三號高速公路南下，由林邊交流道下接台十七公路，往東港行駛即可抵達東港碼頭，再搭交通船到小琉球